Это не связано с Discord.js
Вы можете попробовать отключить его командой eval, если она у вас есть.
Также бот не выключится, если вы запуститедругой пример, это похоже на работу учетных записей пользователей.Вы можете одновременно запускать свою учетную запись на телефоне и компьютере или на двух разных вкладках браузера одновременно.
У учетных записей пользователей также есть токены.
И если Glitch автоматизировал-испускает функцию, вам не нужно каждый раз запускать другой экземпляр.
Вы можете просто сгенерировать токен вашего бота, чтобы он подписался.