Анаконда - это способ распространения Python, где Jupyter и Atom - это способы взаимодействия с интерпретатором Python.Atom - это традиционный текстовый редактор, используемый только для написания кода на Python, а Jupyter намного сложнее, это скорее набор инструментов, вращающихся вокруг математики, науки и больших данных, и позволяет вам писать / запускать python / julia / r / scala/ etc скрипты.