Изменение этого параметра в настоящее время невозможно в Azure CLI 2.0, но было бы неплохо, если бы вы могли подать проблему здесь (лучше, если речь идет о клиентах).
Однако,Вы можете использовать Azure PowerShell для достижения этой цели сегодня.
$webapp = Get-AzureRmWebApp -ResourceGroupName rg -Name name
$webapp.SiteConfig.DefaultDocuments.Add("new.html")
Set-AzureRmWebApp $webapp