Я пытаюсь использовать перманову для проверки эффектов лечения и взаимодействия в схеме исследования, в которой блокировка должна рассматриваться как случайный эффект, а одно лечение сочетается с другим.
Есть графики свысокой или низкой плотности, и на каждом участке имеются участки с обработкой A на одном участке, обработкой B на другом.Конструкция представляет собой латинский квадрат с только одним повторением каждой комбинации процедур в каждом эффекте блока (вертикальное и горизонтальное блокирование), поэтому блокирование следует рассматривать как случайный эффект.
Переменная ответа - процент покрытиявидов растений в сообществе.
Данные настроены таким образом:
Treatment hblock vblock Inoc sp1 sp2 …
1 1 1 1 0.2 0.25
2 2 1 2 0.3 0.9
1 3 1 2 0.2 0.2
2 4 1 1 0.01 0.001
Где «Обработка» - обработка высокой и низкой плотности, а «Инок» - обработка «Aили B "в подзадачах.
У меня такой вопрос, поскольку я не могу использовать случайные эффекты в перманенте, насколько я могу судить по чтению об этом, могу ли я объяснить блокирующие эффекты, вложив взаимодействиевнутри блоков - вот так:
adonis(formula = temp[, -c(1:4)] ~ temp$Inoc * temp$Treatment , method = "bray", strata = temp$Vblock * temp$Hblock, permuatations = 1000)
Или этот подход неверен?