Какая аппаратная конфигурация у вашего кластера?Сколько памяти у кучи Java?Сколько ядер?Какова скорость вашего диска?
Кроме того, где ваша инфраструктура?В помещении или в облачном сервисе?
Вам действительно нужны все поля в документе?Как соотносится ваш индекс?
Если вы уже попробовали методы для повышения производительности, возможно, вы не можете ничего сделать, миллионы документов, тысячи полей для каждого из которых действительно будут занимать время для индексации.