Вам нужно будет запустить его в командной строке для вашей ОС (а не оболочки для MySQL, как вы пробовали ранее).
В Linux (включая Mac) это будет выглядеть примерно так:
smm@smm-HP-ZBook-15-G2:~/$ mysqldump -u myusername -pmypassword -d olddb | mysql -u myusername -pmypassword -D newdb
Под Windows:
C:\> mysqldump -u myusername -pmypassword -d olddb | mysql -u myusername -pmypassword -D newdb
Предполагается, что mysqldump находится в PATH для вашей командной строки (это не так, если вы получаете сообщение об ошибке «команда не найдена»).Как использовать командную строку и настроить PATH, зависит от операционной системы и выходит за рамки этого ответа.