git add .
добавляет все файлы в стадию, и вам нужно зафиксировать свои изменения, используя следующую команду.
git commit -m 'commit message'
только тогда мы появимся в github при использовании команды
git push
И еще, git не отслеживает пустые каталоги.Вы можете сделать пустой коммит с помощью git commit --allow-empty
, но это не позволит вам зафиксировать пустую структуру папок, поскольку git не знает или не заботится о папках как об объектах - только о файлах, которые они содержат.