В платформе Entity у вас нет прямого доступа к таблицам соединений.
Вы связываете объекты друг с другом, и платформа добавляет или удаляет соответствующие строки в таблицах соединений.
Поначалу это может сбивать с толку, но как только вы к этому привыкнете, это упрощает ваш код.