Очистить заголовок файла fasta - PullRequest
0 голосов
/ 08 октября 2018

У меня есть большой файл fasta с таким заголовком

>sample_1 M04839:239:000000000-BVKC2:1:1105:7523:23617;size=450

Мой желаемый результат:

>sample_1;size=450

Как я могу это изменить?

1 Ответ

0 голосов
/ 08 октября 2018

Не могли бы вы попробовать следующее.

awk -F'[ :;]' '{print $1,$NF}' OFS=";"  Input_file
>sample_1;size=450
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...