V1 <- c("a", "a", "b", "b", "b")
V2 <- c("c" ,"d", "e" ,"e", "f")
V3 <- c("i", "j", "k", "l", "m")
dtf <- data.frame(V1, V2, V3)
num <- sapply(dtf, function(x) cumsum(-duplicated(x) + 1))
(m <- sapply(1:3, function(x) paste(x, num[, x], dtf[, x], sep=".")))
# [,1] [,2] [,3]
# [1,] "1.1.a" "2.1.c" "3.1.i"
# [2,] "1.1.a" "2.2.d" "3.2.j"
# [3,] "1.2.b" "2.3.e" "3.3.k"
# [4,] "1.2.b" "2.3.e" "3.4.l"
# [5,] "1.2.b" "2.4.f" "3.5.m"
Это матрица без имен столбцов, но мы можем это исправить.
as.data.frame(m, col.names=colnames(dtf))
# V1 V2 V3
# 1 1.1.a 2.1.c 3.1.i
# 2 1.1.a 2.2.d 3.2.j
# 3 1.2.b 2.3.e 3.3.k
# 4 1.2.b 2.3.e 3.4.l
# 5 1.2.b 2.4.f 3.5.m