Предупреждение о том, что для установки модуля необходимо загрузить предварительно скомпилированные двоичные файлы.
sqlite3 - это собственный модуль, поэтому его необходимо либо собрать из исходного кода, либо установить через двоичную загрузку.Если у вас установлена Visual Studio, вы можете попробовать npm install sqlite3 --build-from-source, что также является более безопасным вариантом.