Я думаю, что нашел ответ, или, по крайней мере, в правильном направлении.
Вам необходимо заново зарегистрировать тему в потоке.После небольшого взлома мне удалось снова присоединить мои темы к потокам, отбросить потоки.
REGISTER TOPIC <ksql_topic_name> WITH (KAFKA_TOPIC='<kafka_topic_name>', VALUE_FORMAT='<format>');
Затем
DROP STREAM <stream_name>;
Я не знаю, работает ли это ввсе дела, но это вернуло меня туда, где я хочу быть.Если кто-то еще может повторить это и найти более надежное решение, я хотел бы услышать об этом.