Просто используйте .format()
метод строкового объекта для получения строки запроса sql:
SQL = "select * from {}.{} where {} is NOT NULL;".format(x, y, z)
Или добавьте значения следующим образом:
SQL = "select * from " + str(x) + "." + str(y) + " where " + str(z) + " is NOT NULL;"
Я рекомендую первое решение.