Перейдите в Панель управления Java и на вкладке Java выберите Вид. В поле Runtime Parameters для данной JRE добавьте:
-javaagent=c:\MyAgent.jar
при условии, что ваш агент находится в файле MyAgent.jar.
В зависимости от вашего агента вывод кода должен отображаться в консоли Java.