Согласно документам NSHTTPCookieStorage, куки не распределяются между приложениями:
Да, UIWebView по умолчанию имеет режим приватного просмотра.Данные Cookie доступны только для приложения.
Singleton instance NSHTTPCookie хранит информацию Cookie UIWebView.Возможно, вам придется использовать deleteCookie: метод для очистки кэшированных данных
Я полностью согласен с @Scriptable Для пользовательского интерфейса, такого как Safari, вам необходимо спроектировать в соответствии с вашими требованиями