Вам лучше провести тесты на другом экземпляре базы данных.Например, вы можете сделать это в базе данных sqlite в памяти (очень удобно, так как у вас совсем нет настроек).Для этого замените ваш URI базы данных следующим:
sqlite:///:memory:
Однако sqlite может вести себя немного иначе, если вы используете, например, PostgreSQL или другой менеджер баз данных.Поэтому вам, вероятно, лучше создать тестовую базу данных в менеджере баз данных.
PS: Если вы используете sqlalchemy рядом с flask, я настоятельно рекомендую использовать модуль flask_sqlalchemy , который сделает вашу работупроще.