Используйте этот код
[[NSUserDefaults standardUserDefaults] removeObjectForKey:@"MyKey"];
не забудьте синхронизировать, если хотите сохранить сразу
[[NSUserDefaults standardUserDefaults] synchronize];
Описание класса NSUserDefaults
синхронизация - этот метод вызывается автоматически с периодическими интервалами, используйте этот метод, только если вы не можете ждать автоматической синхронизации (например, если ваше приложение готовится к выходу) или если вы хотите обновить пользователь по умолчанию использует то, что находится на диске, даже если вы не внесли никаких изменений.