Переместите ng-disabled во входной тег.Это должно работать.
<div ng-controller="SettingsController">
<md-input-container ng-class="{'md-block' : model.isDisable" >
<input ng-model="obj.name" aria-label="name" ng-disabled="model.isDisabled" />
</md-input-container>
</div>
Также в ng-классе есть неуместное '{', которое беспокоит меня, но код все еще работает, поэтому я не изменил его, так как не могузнать, если это необходимо.