Использование int heads[m];
в качестве VLA для int с m = 108744
(наряду с другими 4 VLA, которые вы выделяете из 2950
целых чисел), вероятно, вызывает StackOverflow ... (это будет компилятор, ОС и память- зависит от модели).Чтобы устранить проблему, измените CSRgraph
, чтобы члены heads
и offsets
были указателями, а затем динамически распределяли хранилище на основе чисел, считанных из первой строки файла, например,
typedef struct { /* typdef for convenience */
int *heads,
*offsets;
} CSRgraph_t;
int main (int argc, char **argv) {
CSRgraph_t g; /* declare instance of struct */
...
/* allocate/validate g.heads & g.offsets */
if (!(g.heads = malloc (m * sizeof *g.heads))) {
perror ("malloc-g.heads");
return 1;
}
/* calloc used to zero g.offsets */
if (!(g.offsets = calloc ((n + 1), sizeof *g.offsets))) {
perror ("malloc-g.offsets");
return 1;
}
g.offsets[0] = 0;
g.offsets[n] = m;
...
( примечание: calloc
используется для offsets
, чтобы инициализировать его всеми нулями при последующем сравнении p < g.offsets[curr+1]
)
Если сложить все вместе, вы можете сделать:
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
typedef struct { /* typdef for convenience */
int *heads,
*offsets;
} CSRgraph_t;
int main (int argc, char **argv) {
CSRgraph_t g; /* declare instance of struct */
int n, m, counter, current;
n = m = counter = current = 0;
/* use filename provided as 1st argument (stdin by default) */
FILE *fp = argc > 1 ? fopen (argv[1], "r") : stdin;
if (!fp) { /* validate file open for reading */
perror ("file open failed");
return 1;
}
if (fscanf (fp, "%d %d", &n, &m) != 2) { /* validate EVERY read */
fputs ("error: invalid format n, m.\n", stderr);
return 1;
}
/* allocate/validate g.heads & g.offsets */
if (!(g.heads = malloc (m * sizeof *g.heads))) {
perror ("malloc-g.heads");
return 1;
}
/* calloc used to zero g.offsets */
if (!(g.offsets = calloc ((n + 1), sizeof *g.offsets))) {
perror ("malloc-g.offsets");
return 1;
}
g.offsets[0] = 0;
g.offsets[n] = m;
for (int x = 0; x < m; x++) {
int src; /* src is only needed within scope of loop */
if (fscanf (fp, "%d %d", &src, &g.heads[x]) != 2) {
fprintf (stderr, "error: invalid format - line %d.\n", x);
}
if (src < n+1) {
if (src == current)
counter++;
}
else {
g.offsets[src] = counter + g.offsets[src -1];
counter = 1; /* restart edge origin counter */
current = src; /* set current to current source */
}
}
if (fp != stdin) fclose (fp); /* close file if not stdin */
int Discovered[n], Queue[n+1], Explored[n],
*front_ptr, *end_ptr, *exp_ptr;
front_ptr = Queue; /* front pointer to the Queue array */
end_ptr = Queue; /* end pointer to the Queue array */
exp_ptr = Explored; /* explored pointer to the Explored array */
for (int x = 0; x < n; x++)
Discovered[x] = 0;
/* Advance the pointers in the direction you want */
*end_ptr = 0;
end_ptr++;
Discovered[0] = 1;
while (front_ptr != end_ptr) {
int curr = *front_ptr;
front_ptr++;
*exp_ptr = curr;
exp_ptr++;
for (int p = g.offsets[curr]; p < g.offsets[curr+1]; p++) {
if (Discovered[g.heads[p]] == 0) {
Discovered[g.heads[p]] = 1;
*end_ptr = g.heads[p];
end_ptr++;
}
}
}
free (g.heads);
free (g.offsets);
return 0;
}
( примечание: избегайте жесткого кодирования имен файлов, например, fopen("filename.graph","r")
, main()
принимает аргументы, используйте их для передачи имени файла в качестве первого аргумента вашей программе [и вы можете читать из stdin
по умолчанию, если аргумент не указан])
Использование памяти / проверка ошибок
$ valgrind ./bin/readgraphsfile ~/tmp/graphfile/large.graph
==17345== Memcheck, a memory error detector
==17345== Copyright (C) 2002-2015, and GNU GPL'd, by Julian Seward et al.
==17345== Using Valgrind-3.12.0 and LibVEX; rerun with -h for copyright info
==17345== Command: ./bin/readgraphsfile ~/tmp/graphfile/large.graph
==17345==
==17345==
==17345== HEAP SUMMARY:
==17345== in use at exit: 0 bytes in 0 blocks
==17345== total heap usage: 3 allocs, 3 frees, 447,332 bytes allocated
==17345==
==17345== All heap blocks were freed -- no leaks are possible
==17345==
==17345== For counts of detected and suppressed errors, rerun with: -v
==17345== ERROR SUMMARY: 0 errors from 0 contexts (suppressed: 0 from 0)
Он отлично работает с вашим large.graph
файлом.