У меня возникла та же проблема (очень неожиданная «В папке наборов инструментов NDK для ABI с префиксом: mips64el-linux-android» не найдено никаких цепочек инструментов), когда я открыл старый проект и исправил его, обновив некоторые параметры сборки:
Заменить
classpath 'com.android.tools.build:gradle:3.0.1'
на
classpath 'com.android.tools.build:gradle:3.2.1'