Я столкнулся с подобной проблемой, используя lamp , проверьте, что у вас может быть более двух путей mysql, как в
Найдите все остальные mysql, установленные в вашей системе
`whereis mysql`
`mysql: /opt/lampp/bin/mysql /opt/lampp/bin/mysql.server /usr/share/man/man1/mysql.1.gz`
Теперь, если в вашей системе два mysql, если они перекрываются, удалите другие и оставьте только один mysql, установленный лампой
sudo rm -rf /etc/mysql
Вот ссылка, которую я нашел для apache2. Я сделал то же самое с mysql.и он работает http://xmodulo.com/how-to-uninstall-and-remove-apache2-on-ubuntu-debian.html
Наконец остановите все существующие службы mysql, работающие
sudo service mysql stop
sudo /etc/init.d/apache2 stop
sudo /opt/lampp/lampp start