Вы смешиваете html и текстовый тип контента.
Либо используйте только текст, где \r\n
хорошо, либо используйте <br>
, который предназначен для HTML, который подходит для вашего случая (у вас также есть <a href..
).
$mail->Body= $msg1 . "<br>" . $msg2;