Ответ, полученный от phonegap github: https://github.com/phonegap/phonegap-plugin-push/issues/2415, в котором говорится:
Событие on ('registration') вызывается, если происходит обновление токена.Каждый раз, когда вы получаете событие регистрации, вы должны проверять, отличается ли это значение от того, которое вы имели ранее.Если это так, отправьте его на сервер.