Я изменил с Git на SVN папки, содержащие код проекта, но IntelliJ выглядит так же, как и раньше, поэтому я не могу работать с SVN
Ctrl + Alt + S (Настройки проекта) -> Контроль версий
В нем должен быть указан каталог проекта и какие VCS он использует. Измените это там.
Вот хороший документ, касающийся проблем с несколькими системами контроля версий:
Сайт IntelliJ