В консоли отладки FF нет сообщения, которое бы вам помогло? Я не помню каких-либо ограничений на виджет дерева додзё относительно количества объектов, которые он может обработать.
Моим первым предложением будет посмотреть идентификаторы вашего магазина. убедитесь, что эти идентификаторы являются уникальными. Например, попробуйте создать itemFileReadStore из вашего объекта json и использовать его в дереве.
var store = new dojo.data.ItemFileReadStore({identifier:'idfield', label:'something', data:{items:yourjsonobject}})
удачи