Используя ggplot2 и viridis, заполните гистограмму на основе другой переменной - PullRequest
0 голосов
/ 12 июня 2018

Я пытаюсь создать верхний левый график на этом рисунке в ggplot, используя viridis для создания цветового градиента.enter image description here

Вот мои примеры данных:

# simulate t-values
data = data.frame(sim =1:10000,
                  t_0= rt(n = 10000,df =12, ncp=0), 
                  t_1 = rt(n = 10000,df =12, ncp=1.2))
# compute p-values
data = data %>% 
  mutate(p_0 = 2* pt(t_0, df=12, lower.tail = ifelse(t_0 > 0,FALSE ,TRUE)),
         p_1 = 2* pt(t_1, df=12, lower.tail = ifelse(t_1 > 0,FALSE ,TRUE)))

# convert from wide to long
data.long = data %>% 
  gather(condition,measurement, t_0:p_1) %>%
  separate(col=condition, into=c("para","hyp"), sep = "_")

# convert to wide repeated measures format
data.wide = data.long %>% spread(key = para, measurement)

Чтобы создать графики слева, мне нужно раскрасить гистограмму в соответствии с соответствующими значениями вправильные графики.Если t = 0 (соответствует ap близко к 1), график должен быть желтым, если t> 4 (соответствует ap близко к 0), заливка должна быть темно-синей. В этом посте показано, как создать подобный график с помощью scale_fill_gradientn, который, к сожалению, не работает с дискретными значениями, которые я создал с помощью cut ().

Это самое близкое, что я пришел,однако я хочу, чтобы график имел желтый цвет при смешивании x = 0 с темно-синим по краям.

# create bins based on t-values
t0bins <- seq(-12, 12, by = 1)
# compute corresponding p-values
pt0bins <- 2*pt(t0bins, df = 12, lower.tail = FALSE)



 ggplot(data.wide, aes(x=t, fill=cut(..x.., breaks=get("t0bins", envir=.GlobalEnv)))) +
  geom_histogram(binwidth=0.1)+
  scale_fill_viridis(discrete=T)

, что дает: enter image description here

1 Ответ

0 голосов
/ 12 июня 2018

Можно попробовать

library(tidyverse)
library(viridis)
data.wide %>% 
  mutate(bins=cut(t, breaks=t0bins)) %>% 
{ggplot(.,aes(x=t, fill=bins)) +
  geom_histogram(binwidth=0.1)+
  scale_x_continuous(limits =c(-12,12)) +
  scale_fill_manual(drop=FALSE,values = c(viridis(nlevels(.$bins)/2), viridis(nlevels(.$bins)/2, direction = -1)))}

enter image description here

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...