В FFmpeg параметры идут перед вводом / выводом для этого конкретного ввода / вывода.
В вашем случае ваша команда будет выглядеть примерно так:
ffmpeg -sample_rate 44100 -f s16le -i - -ar 22050 -codec copy -f wav -
В этомcase, -ar 44100
и -f s16le
применяются к входу, так как они были до входа.
-ar 22050
, -codec copy
и -f wav
применяются к выходу, так как они были после вводано до выхода.