Вы можете использовать rails кроме метода, чтобы удалить атрибут из хэша, в вашем случае вы можете использовать
data_hash = {"data": {"id": "3","type": "movie","attributes": {"name": "test movie","year":''},"relationships": {"actors": {"data": [{"id": "1","type": "actor"},{"id": "2","type": "actor"}]},"owner": {"data": {"id": "3","type": "user"}}}}}
data_hash[:data].except!(:relationships)
Вы получите вывод, как показано ниже
{:id=>"3", :type=>"movie", :attributes=>{:name=>"test movie", :year=>""}}
И data_hash
будет
{:data=>{:id=>"3", :type=>"movie", :attributes=>{:name=>"test movie", :year=>""}}}