form.submit отправляет данные формы на URL, указанный в action
.Учитывая проблему, о которой вы сообщаете, я подозреваю, что ваше действие - это та же страница.Поэтому при перезагрузке LI, который вы добавили динамически, больше не существует из-за перезагрузки страницы.Имеет смысл?
form.addEventListener("submit", function(){
var task = document.querySelector('input').value;
let li = document.createElement('li');
li.append(count + ' ' + task);
taskList.append(li);
});