Как уже упоминалось в комментариях, это похоже на ошибку в узле - вы можете исправить с помощью
const reformat = s => s.replace(/[,.]/g, x => ({'.':',', ',':'.'})[x]);
console.log(reformat('R$2,312.31'))
Вы также можете установить охрану на замену:
s => /\.\d{2}$/.test(s) ? s.replace(/[,.]/g, x => ({'.':',', ',':'.'})[x]) : s
Используйте его в своей библиотеке следующим образом:
module.exports = {
format: function (number) {
let value = number.toString()
let teste = value.slice(0, -2) + '.' + value.slice(-2)
let newvalue = Number(teste)
const reformat = s => /\.\d{2}$/.test(s) ? s.replace(/[,.]/g, x => ({'.':',', ',':'.'})[x]) : s
return reformat(newvalue.toLocaleString('pt-BR', { style: 'currency', currency: 'BRL' }))
}
}