Как правило, нет, вы не можете использовать агент с одного сервера политики с другого. Протокол агента <-> Policy Server не является стандартным протоколом.
Однако, если вы хотите настроить федерацию между экземпляром SiteMinder и экземпляром Open SSO, вам может повезти больше. Здесь - статья от Sun, описывающая один сценарий его настройки.
Open SSO поддерживает SAML 2.0 и SAML 1.1, если это помогает.