Во-первых, время ожидания соединения и время ожидания команды не одно и то же.Убедитесь, что вы понимаете разницу и правильно их используете.
Во-вторых, если это с веб-страницы, вам также необходимо учесть значения времени ожидания, относящиеся к веб-серверу и т. Д.
Третий, чтобы убедиться, что это действительно проблема с тайм-аутом, выполните инструкцию index в SSMS и выясните, сколько времени это займет.Поскольку фактическое индексирование выполняется на сервере SQL независимо от того, откуда он вызывается, время индексирования должно быть примерно одинаковым независимо от того, выполняется ли оно из SSMS или из вашего приложения.