Вы перечисляете содержимое папки
hdfs dfs -ls /input
Посмотрите на все, а не файл
Затем удалите папки, перечисленные в сообщении об ошибке, как не файлы
hdfs dfs -rm -R /input/input
Затем снова загрузите ваши данные
hdfs dfs -copyFromLocal file.txt /input/