Как добавить три цвета в горизонтальные полосы при условии факторной загрузки более 0,5 - PullRequest
0 голосов
/ 14 октября 2018

Вот мои данные

Parameters  RC1 RC2 RC3
NSC.Glucose 0.22    0.97    0.06
NSC.Fructose    0.38    0.57    0.1
NSC.Sucrose 0.13    0.63    0.06
NSC.Starch  0.23    0.72    0.06
Enzyme.INV  0.22    0.97    0.06
Enzyme.SPS  0.62    0.64    0.16
Enzyme.PGM  0.74    0.52    0.43
Enzyme.PFP  0.11    0.97    -0.02
Enzyme.AGP  -0.06   0.91    0.2
Enzyme.PGI  0.65    0.73    -0.2
Photosynthesis.Pn   0.12    0.82    0.15
Photosynthesis.Gm   0.02    0.38    0.01
Photosynthesis.Jmax 0.12    0.82    0.15
photosynthesis.Vcmax    0.12    0.82    0.15
gene.FBA    0.26    0.69    -0.03
gene.FBP    0.36    0.69    -0.02
gene.BFII   0.18    -0.78   -0.18
gene.CAB    0.23    0.73    0.05
gene.RuBisCo    0.31    0.75    -0.06
gene.RCA    0.49    0.28    0.07
gene.RPI    0.48    0.26    0.1
gene.PAL    0.43    -0.1    -0.14
gene.PSII   0.28    0.74    0.09
gene.STP    0.64    -0.41   -0.02

Я хочу подготовить горизонтальную линейную диаграмму с помощью ggplot2. Мне нужна такая фигура (рисунок ниже): RF loading as horizontal barplot

Я написал этонужна помощь

library(ggplot2)
rf1<-read.table("I:/Sayantan/SayantanPhotosynthesis/Exceldata/RF.txt",header=T,sep="\t")
g<-ggplot(data = rf1, aes(y =RC1, x = Parameters, fill = RC1 < 0)) +geom_col() +coord_flip()
print (g)

1 Ответ

0 голосов
/ 14 октября 2018

Один из подходов состоит в том, чтобы условно выбрать цвет для заполнить бары:

df$fill <- ifelse(abs(df$RC1) > 0.5, "black", "white")          # conditional fill

library(ggplot2)
ggplot(df, aes(x= Parameters, y = RC1)) + geom_col(aes(fill = I(fill)), colour = "black") + 
     coord_flip() + theme_bw(base_size=10) + 
          geom_hline(yintercept = 0.5, color = 'black', linetype = "dotted")    
          # add another geom_hline if you need for - 0.5

Factor loadings

данные:

df <- read.table(text = "Parameters  RC1 RC2 RC3
NSC.Glucose 0.22    0.97    0.06
NSC.Fructose    0.38    0.57    0.1
NSC.Sucrose 0.13    0.63    0.06
NSC.Starch  0.23    0.72    0.06
Enzyme.INV  0.22    0.97    0.06
Enzyme.SPS  0.62    0.64    0.16
Enzyme.PGM  0.74    0.52    0.43
Enzyme.PFP  0.11    0.97    -0.02
Enzyme.AGP  -0.06   0.91    0.2
Enzyme.PGI  0.65    0.73    -0.2
Photosynthesis.Pn   0.12    0.82    0.15
Photosynthesis.Gm   0.02    0.38    0.01
Photosynthesis.Jmax 0.12    0.82    0.15
photosynthesis.Vcmax    0.12    0.82    0.15
gene.FBA    0.26    0.69    -0.03
gene.FBP    0.36    0.69    -0.02
gene.BFII   0.18    -0.78   -0.18
gene.CAB    0.23    0.73    0.05
gene.RuBisCo    0.31    0.75    -0.06
gene.RCA    0.49    0.28    0.07
gene.RPI    0.48    0.26    0.1
gene.PAL    0.43    -0.1    -0.14
gene.PSII   0.28    0.74    0.09
gene.STP    0.64    -0.41   -0.02", header = TRUE , colClasses = c("character", rep("numeric", 3)))
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...