modelr add_residuals для биномиального glm с ответом матрицы в столбце списка - PullRequest
0 голосов
/ 17 декабря 2018

Я пытаюсь заставить modelr::add_residuals делать свое дело для фреймов данных, вложенных в столбец списка.Когда я пытаюсь unnest(), я получаю сообщение "Ошибка в bind_rows".

Модель ввода - это биономный блеск с матричным откликом, который, кажется, является частью проблемы.

Вот пример:

library(tidyverse)
library(modelr)
library(doBy)
data(budworm)

fitter <- function(df, ...){
  # fit binomial glm to matrix response
  res <- glm(cbind(ndead, ntotal) ~ log(dose), data = df, family = binomial)
  return(res)
}

# create nested data frames
bg <- budworm %>% 
  group_by(sex) %>% 
  nest()

bg %>% 
  mutate(fits = map(data, fitter),
         res = map2(data, fits, add_residuals))  %>% 
  unnest(res)

И ошибка отunnest() is:

Ошибка в bind_rows_ (x, .id): аргумент 4 должен быть длиной 6, а не 12

Я отмечаю, что add_predictions() неесть эта проблема.

Мне интересно, связана ли проблема с матрицей в качестве ответа для glm (обычно для приложений типа анализа, как в примере с budworm).Единственная неопределенно похожая проблема, которую я нашел, касается пакета метлы здесь .Однако, похоже, что это связано и с unnest, поскольку add_residuals() отлично работает с фреймом данных, который не хранится в столбце списка.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...