Краткий ответ: Да, это будет (по умолчанию). Он пытается облегчить вам задачу:)
Длинный ответ: Если вы захотите, вы можете не копировать DLL. Кроме того, если вы ссылаетесь на GAC, то это не так (аналогично тому, как обрабатываются системные библиотеки DLL).