Если вместо фактического вывода плагина отображается только строка [шорткод], создается впечатление, что при выводе ваших страниц неправильно используется фильтр do_shortcode.Не зная точно, что происходит, попробуйте следующее:
function filter_content_example($content) {
$content = do_shortcode($content);
return $content;
}
add_filter('the_content', 'filter_content_example');
Это только первое предположение.Без дальнейшего расследования я не смог бы решить эту проблему.