Мне нужна помощь с командой sed, которая, как я думал, поможет решить мою проблему.У меня в основном есть длинные текстовые файлы, которые выглядят примерно так:
>TRINITY_DN112253_co_g1_i2 Len=3873 path=[38000:0-183]
ACTCACGCCCACATAAT
Текстовые блоки ACT продолжаются, и затем появляются другие блоки текста, которые следуют той же схеме, за исключением текста после> отличаетсянемного по номерам.Я хочу заменить только эту часть заголовка (часть, сопровождаемую>) на все, вплоть до самой последней «_» команды sed, которая, на мой взгляд, выглядит логичной, выглядит следующим образом:
sed -i ‘s/>.*/TRINITY.*_/‘
Однако sed - этобуквально меняя каждый заголовок на TRINITY. * _ вместо того, чтобы захватывать блок, который я думал, что будетЛюбая помощь приветствуется!
(Также ... просто чтобы прояснить ситуацию, я подумал, что моя команда sed преобразует блок верхнего заголовка в это:
>TRINITY_DN112253_co_g1_
ACTCACGCCCACATAAT