Вы можете использовать массив am4core.registry.baseSprites
и использовать собственные методы JavaScript для его фильтрации.
Найти по идентификатору html:
var id = 'chartdiv';
var chart = am4core.registry.baseSprites.find(c => c.htmlContainer.id === id);
Найти по имени класса html:
var className = 'my-class';
var chart = am4core.registry.baseSprites.find(c => Array.from(c.htmlContainer.classList).includes(className));
Поиск по идентификатору диаграммы:
var id = 'myId';
var chart = am4core.registry.baseSprites.find(c => c.id === id);