Они находятся под "Исключенными" изменениями.Вы увидите маркер с надписью «Обнаружено: X добавляет» или «Y удаляет».Вы можете нажать на нее, чтобы продвигать их к отслеживаемым изменениям.Предполагается, что материал, который добавляется или удаляется за пределами Visual Studio, не предназначен для управления исходным кодом, поэтому он не начинает отслеживать, пока вы не скажете, что хотите, чтобы они отслеживались.