Да, вы можете просто активировать среду (это зависит от вашей версии conda и операционной системы)
Начиная с conda 4.4:
conda activate myenv
До conda 4.4:
Windows:
activate myenv
Linux / MacOS:
source activate myenv
Установка ...
и затем установите в него все нужные вам пакеты (conda рассматривает python как пакет)
conda install python=3.6
Как уже упоминалось в комментариях, вы также можете установить непосредственно в среду без активации:
conda install -n myenv python=3.6