Если вы хотите сохранить оба файла, проверьте, существует ли он, и переименуйте его перед копированием.Для проверки, если он существует, вы можете использовать следующий фрагмент.
Dim fso As New FileSystemObject
Dim filepath As String
filepath = "yourfilepath"
While fso.FileExists(filepath)
'rename it
Wend
Для использования FileSystemObject
необходимо установить ссылку на Windwos Script Host Object Model
EDIT : чтобы ответить на ваш комментарий: Вы можете проверить, существует ли изатем откройте окно сообщения:
If MsgBox("Override", vbYesNo) = vbYes Then
End If