Нет проблем.Вы, похоже, копируете динамический модуль в существующую установку nginx.
nginx -V
покажет команду configure
, которая использовалась при компиляции nginx.Поэтому он не будет отображать параметры конфигурации для динамического модуля, скомпилированного на отдельном шаге, и не будет отображать загруженные модули.
Просто используйте директивы модуля.Это должно работать.