Не уверен, что я правильно понял ваш вопрос, потому что в нем не так много деталей.Если у вас есть координаты какой-либо точки на виде диаграммы в системе координат вида (скажем, viewPoint) и вы хотите получить координаты этой точки во внутренней системе координат диаграммы, вы можете получить эти координаты, используя метод valueForTouchPoint(point:axis:), например:
// assuming that your data is related to left yAxis
chartView.valueForTouchPoint(point: viewPoint, axis: .left)