Я не думаю, что вы можете это исправить - среда сценариев Python в Azure ML Studio довольно закрыта, вы не можете ее настроить (за исключением выбора из небольшого выбора версий Anaconda / Python).
Возможно, вам лучше воспользоваться новой службой Azure ML, которая позволяет значительно расширить возможности конфигурации (включая использование графических процессоров и т. П.).