Я новичок в SimpleITK и регистрация с использованием SimpleElastix.У меня есть набор МРТ пациентов с соответствующими объемами этикеток.Я сделал groupwise регистрацию, следуя инструкции в SimpleElastix как для изображений, так и для этикеток.Я пытаюсь повторить аналогичную процедуру этапа регистрации для моих данных, которая была упомянута в одном из связанных документов.
авторы использовали жесткую регистрацию нескольких атласов, регистрируя два скана путем максимизации нормализованной взаимной информации (NMI) с использованием техники оптимизации LBFGS .После регистрации интенсивность трех структур интересов варьировалась до 0,92, 0,85 и 0,73, что дает пространственный приоритет объекта алгоритму сегментации.
Авторы также упоминали, что они регистрировали каждое сканирование длявсе обучающие сканы (например, регистрация GroupWise, если я не ошибаюсь), где оптимизация была инициализирована переводом, подразумеваемым центром масс ручной сегментации заданной структуры интереса.
У меня следующие вопросы:
- Как я могу назначить NMI и LBFGS процессу регистрации во время регистрации в GroupWise?Я прочитал документацию SimpleElastix, в которой упоминалось о NMI и LBFGS, однако я не знаю, как мы можем присвоить эти параметры векторной карте параметров.
Могу ли я добавить параметры в groupwise registrationчто-то похожее на код в этой ссылке ?Например:
параметрMapVector = sitk.VectorOfParameterMap ()*
Ваша помощь очень ценится