Для Ubuntu, установленного из Microsoft Store:
Каждый дистрибутив, который вы устанавливаете через Microsoft Store, устанавливается в каталог appdata этого приложения.Например: C:\Users\%USERNAME%\AppData\Local\Packages\CanonicalGroupLimited.Ubuntu18.04onWindows_79rhkp1fndgsc\LocalState\
источник
Каталог по умолчанию Ubuntu 18.04 /home
находится в C:\Users\%USERNAME%\AppData\Local\Packages\CanonicalGroupLimited.Ubuntu18.04onWindows_79rhkp1fndgsc\LocalState\rootfs\home\
Предупреждение:Создание или изменение любых файлов в подсистеме Windows для Linux из Windows может привести к потере или повреждению данных в Ubuntu, поэтому делайте копии этих файлов перед их использованием и используйте копии в Windows, а не в исходных файлах.
Обновление Windows 10 апреля 2019 года даст подсистеме Windows для Linux новую возможность безопасного доступа к файлам Linux из Windows.