Здесь была проблема, у меня было несколько элементов с одинаковым именем класса.То, что делал транспортир, брало первый элемент с этим классом.То, что он должен был сделать, это взять второй, но связанный элемент с этим классом.
Я попробовал element.all(by.className('menu')).get(1)
, и он отлично работает.
Спасибо за вашу помощь @yong и @Kacper за то, что вы указали мне правильное направление.