Страница man для mq_send указывает, что она реализована поверх mq_timedsend, который является системным вызовом в Linux. Системные вызовы, как правило, являются атомарными в том смысле, что они либо успешны, либо нет. Если системный вызов прерывается сигналом, обычное поведение - вернуть -1 и установить errno в EINTR. Похоже, что mq_send имеет такое поведение.
Как правило, вы должны проверить EINTR и повторить вызов, если он не пройдет таким образом. Это особенно важно для системных вызовов, которые могут блокироваться как recv или select, так как они имеют более высокий шанс прерывания.