Самый простой способ - увеличить ranksep - минимальное расстояние между двумя рядами.Это должно оставить больше места для ребер, по крайней мере, если вы используете точку.
Если концентрация ребер обусловлена множеством узлов одного ранга, вы можете использовать unflatten утилита .Включение этого шага в генерацию графа позволяет распределить узлы одного ранга по разным рангам и, следовательно, сделать граф более узким (но более длинным), создавая некоторое пространство между узлами.Края отдельных узлов должны быть легче различимы.Полный пример использования утилиты unslatten (с рисунком) можно найти в этом ответе .